Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms