Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf5P56477 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf5P56477 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf5P56477 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Irf5P56477 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Irf5P56477 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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