Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms