Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms