Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms