Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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