Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VdrP48281 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VdrP48281 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VdrP48281 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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