Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms