Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms