Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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