Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprkP35822 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprkP35822 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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