Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rab5cP35278 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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