Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sftpa1P35242 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms