Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc10P31257 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc10P31257 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms