Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VtnP29788 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms