Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprmP28828 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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