Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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