Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2afxP27661 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2afxP27661 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms