Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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