Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a2P20490 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms