Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PdgfaP20033 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PdgfaP20033 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PdgfaP20033 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PdgfaP20033 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PdgfaP20033 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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