Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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