Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms