Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms