Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LdhbP16125 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms