Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms