Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms