Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms