Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms