Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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