Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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