Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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DffaO54786 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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DffaO54786 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffaO54786 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DffaO54786 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
DffaO54786 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DffaO54786 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DffaO54786 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms