Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms