Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Edil3O35474 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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