Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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