Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcns1O35173 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms