Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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