Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MttpO08601 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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