Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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