Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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