Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms