Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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