Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms