Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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