Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms