Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms