Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XntrpcF8VQM8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms