Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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