Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms