Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmod3E9QA62 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms